Centrum referencyjne świadczy następujące usługi:
- referencyjne – udostępnianie ogólnych informacji (informacje o Muzeum Żydowskim w Pradze, wystawach i imprezach)
- bibliograficzne – podstawowe kwerendy
- konsultacyjne – skierowanie do specjalistów Muzeum Żydowskiego w Pradze i do organizacji współpracujących (spokrewnionych)
- reprograficzne – kopiowanie
- muzealna baza danych działu holocaustu (baza danych ofiar holocaustu) i działu zbiorów (baza rysunków dzieci z Terezína)
- multimedialne encyklopedie tematyczne na płytach CD
- specjalistyczne bazy danych on-line (Jewish encyclopaedia, Compact memory, Encyclopaedia Judaica, Otzar ha-chochma, Index to Jewish Periodicals, …)
- katalog on-line biblioteki Muzeum Żydowskiego w Pradze
- dostęp do zdigitalizowanych czasopism
- z biblioteki podręcznej dla potrzeb studiów dziennych:
- słowniki, publikacje o charakterze encyklopedycznym (powszechne i judaistyczne)
- dzieła poświęcone Izraelowi, historii żydowskiej, biblistyce i liturgii, bohemica i pragensie
- publikacje wydawane przez Muzeum Żydowskie w Pradze
- książki adresowe muzeów, bibliotek i galerii
- czasopisma judaistyczne – Roš Chodeš, Judaica Bohemiae, Židovská ročenka i inne